microsoft/Graphormer

About Periodic boundary condition invariance

Open

#137 aperta il 22 set 2022

Vedi su GitHub
 (0 commenti) (0 reazioni) (0 assegnatari)Python (376 fork)auto 404
good first issue

Metriche repository

Star
 (2459 star)
Metriche merge PR
 (Metriche PR in attesa)

Descrizione

For general MPNN as CGCNN and Schnet, crystal graph as multi-graph is invariant under different supercell. I wonder if Graphormer can achieve the same invariance. More specifically, will the results of a unit cell input structure and a supercell structure of Graphormer keep the same? I don't think it achieve pbc invariance as the graph is changed for different supercell. I'm surprised that Graphormer can performs excellent not only molecules but also crystals! Thanks.

Guida contributor

Direzione di ricerca
Investigare l'invarianza delle condizioni al contorno periodiche di Graphormer per le strutture cristalline, esaminando il documento e il codice, e confrontare con MPNN come CGCNN e Schnet per capire se il meccanismo di attenzione di Graphormer rispetta l'invarianza PBC.
Tech stack
python
Dominio
ai
Tipo issue
Ricerca
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
Meno di 1 ora
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Nuova
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Abbastanza chiara
Prerequisiti
machine learninggraph neural networkscrystal structures
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
50