JuliaPlots/Plots.jl

[FR] Improve performance of plotting heatmaps

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#4520 aperta il 15 nov 2022

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Metriche repository

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Descrizione

Reported on Slack by Jesse Chan, repeated calls to plot! to produce overlying heatmaps was very slow.

const mat = randn(512, 512)

function f(x, n)
    plot()
    for _ in 1:n
        heatmap!(x)
    end
end

f(mat, 100)

Allocation profiler shows the large majority of allocations occurring in heatmap_edges: image

And the large majority of computation time in expand_extrema! (which calls heatmap_edges) and update_clims (my old nemesis): image

Guida contributor

Direzione di ricerca
Indaga le funzioni `heatmap edges` e `expand extrema!` all'interno del sorgente di Plots.jl. Il profiler di allocazione indica che la maggior parte delle allocazioni avviene in `heatmap edges`. Concentrati sulla riduzione delle allocazioni in quella funzione, possibilmente pre allocando array o utilizzando operazioni in place. Controlla la discussione nell'issue per ulteriore contesto.
Tech stack
Nessuno
Dominio
performance
Tipo issue
Performance
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
4
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-2 giorni
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Datata
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
Basic Julia knowledgeFamiliarity with Plots.jl internalsProfiling experience
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
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