JuliaDynamics/RecurrenceAnalysis.jl

Improve performance with `fixedrate=true`

Aperta

#47 aperta il 17 gen 2019

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Descrizione

In the calculation of recurrence matrices with fixed recurrence rate there is the issue commented in #46 (indirectly calling distancematrix, which is expensive):

https://github.com/JuliaDynamics/RecurrenceAnalysis.jl/blob/2961a32b29e41ea1e3dc3d63f67e29d74948e5ab/src/matrices.jl#L220-L222

A function that gives the same result as quantile(distancematrix(x,y), ε) without calling distancematrix would help.

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Guida contributor

Direzione di ricerca
Implementare una funzione per calcolare il quantile delle distanze senza costruire l'intera matrice delle distanze, possibilmente utilizzando un algoritmo di selezione come Quickselect o un approccio di campionamento.
Tech stack
julia
Dominio
data
Tipo issue
Performance
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
3
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
JuliaGit
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
60