BfArM-MVH/grz-tools

Check for genome version mismatch: Overlap .bed file with chromosome ranges

Aperta

#464 aperta il 24 nov 2025

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 (1 commento) (0 reazioni) (1 assegnatario)Python (12 fork)auto 404
good first issuepriority: low

Metriche repository

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Metriche merge PR
 (Merge medio 16g 9h) (12 PR mergiate in 30 g)

Descrizione

Check if the chromosome intervals in the .bed file are within the genome range

Guida contributor

Direzione di ricerca
Ispeziona il formato del file BED e implementa un controllo per garantire che gli intervalli cromosomici siano all'interno dei range del genoma.
Tech stack
python
Dominio
bioinformatics
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
2
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
1-3 ore
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
Python
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
70