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[Feature Request] miracl_connect_csd_tractography.sh - option for multi-shell response algorithm

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#196 aperta il 20 apr 2026

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Descrizione

Under line 221, I was wondering if there could be a possibility to allow for multi-shell response algorithm rather than the single-shell approach that is currently present and it could help better characterize fiber crossings

if [[ ! -f $wm_response ]]; then

    dwi2response dhollander $dti $wm_response $gm_response $csf_response \
        -mask $mask -fslgrad $bvec $bval \
        > >(tee response.err) 2> >(tee response.out >&2)

Guida contributor

Direzione di ricerca
Indaga l'algoritmo di risposta multi shell nel comando dwi2response di MRtrix3, in particolare l'opzione 'dhollander', e come modificare lo script per consentire la selezione dell'algoritmo multi shell tramite un argomento della riga di comando.
Tech stack
shell
Dominio
data
Tipo issue
Funzionalità
DifficoltàQuanto dovrebbe essere impegnativa per un nuovo contributor.
3
Tempo stimatoTempo stimato per completare e verificare uno scope piccolo.
Mezza giornata
Stato attivitàQuanto è probabile che la issue sia ancora attiva e reviewable.
Attiva
ChiarezzaQuanto chiaramente la issue descrive problema, scope e risultato atteso.
Chiara
Prerequisiti
shell scriptingdiffusion MRI basics
Adatta ai principiantiQuanto la issue è adatta a contributor alla prima esperienza.
50