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Métriques du dépôt

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299 étoiles (299 étoiles)

Métriques de merge PR

Aucune PR mergée en 30 j (Aucune PR mergée en 30 j)

Description

FASTA file to format: /passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa
FASTA type: nucleotide
Proceed? [y/n] (Default: y): y
Enter a database title or will use 'query sadf copy':
Enter taxid (optional):
Could not create BLAST database for: /passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa
Tried: makeblastdb -parse_seqids -hash_index -in '/passenger/yannick/sequenceserver/databases/query sadf copy.fa' -dbtype nucl -title 'query sadf copy' -taxid 0
stdout:
stderr: BLAST options error: Please provide a database name using -out

Guide contributeur

Direction de recherche

Examinez le code qui construit la commande makeblastdb. Assurez vous que lorsque le nom du fichier d'entrée contient des espaces, la commande inclut correctement l'option ' out' avec un nom de base de donnees valide.

Stack technique

javascript

Domaine

backend

Type d'issue

Bug

DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.

3

Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.

1-3 heures

Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.

Active

ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.

Claire

Prérequis

Basic command lineBLAST understanding

Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.

60