wurmlab/sequenceserver

limit query size and customize /tmp dir

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#535 ouverte le 22 juil. 2021

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Description

We set up a sequenceserver app for public and usually the /tmp dir would ran out of disk storage because of long DNA query sizes resulting in large temporary files.

Therefore two configs are needed: (1) an option that limits the maxium input sequence lengths (2) an option that customize a directory for temporary files.

Guide contributeur

Direction de recherche
Ajoutez deux options de configuration : une pour definir une limite maximale de longueur de sequence d'entree, et une autre pour specifier un repertoire temporaire personnalise. Implementez les dans le fichier de configuration du serveur (par exemple config.ru ou settings) et mettez a jour tout code pertinent traitant du telechargement de fichiers ou de la creation de fichiers temporaires.
Stack technique
javascript
Domaine
backend
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
Git
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
70