sanger-tol/sequencecomposition

DFAM

Ouverte

#25 ouverte le 17 juin 2024

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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Essentially, this is running hmmscan across the entire genome.

Guide contributeur

Direction de recherche
Examinez le pipeline GDA pour comprendre comment hmmscan est implémenté, puis intégrez la fonctionnalité équivalente dans ce pipeline Nextflow.
Stack technique
Aucun
Domaine
data engineering
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
Une demi journée
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Récente
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Plutôt claire
Prérequis
GitNextflow
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
50