sanger-tol/sequencecomposition

LTR retrotransposons from `LTRdigest`

Ouverte

#24 ouverte le 2 juin 2024

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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Guide contributeur

Direction de recherche
Inspectez le pipeline GDA pour voir comment il utilise LTRdigest pour les rétrotransposons LTR, puis examinez les modules existants de ce pipeline pour planifier l'intégration.
Stack technique
Aucun
Domaine
data
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
Une demi journée
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Récente
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Plutôt claire
Prérequis
GitNextflow
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
70