sanger-tol/sequencecomposition

Dustmasker

Ouverte

#16 ouverte le 2 juin 2024

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 (0 commentaire) (0 réaction) (0 personne assignée)Nextflow (3 forks)auto 404
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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline.

dustmasker is part of the blast package.

Guide contributeur

Direction de recherche
Examinez l'implémentation de dustmasker dans le pipeline GDA, déterminez comment l'intégrer comme nouveau processus dans ce pipeline Nextflow et identifiez où il devrait être placé dans le flux de travail.
Stack technique
groovy
Domaine
data
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-2 jours
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Investigation requise
Prérequis
GitNextflow
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
45