pymc-devs/pymc

Only sample using a single thread when sampling multiple chains in parallel

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#5 453 ouverte le 9 févr. 2022

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Description

My prior of what cores=4 does when calling pm.sample() is that pymc would use 4 of my cores. However, because of multi-threading this might not be the case. Furthermore, multi-threading is causing problems when running multiple chains in parallel: https://github.com/pymc-devs/pymc/issues/3140

I thus think we should set os.environ['OMP_NUM_THREADS'] = '1' if we're sampling on > 1 core.

Guide contributeur

Direction de recherche
Définissez os.environ['OMP NUM THREADS'] = '1' dans pm.sample() lors de l'échantillonnage de plusieurs chaînes pour éviter les conflits de multithreading. Consultez l'issue #3140 pour le contexte. Assurez vous que l'échantillonnage d'une seule chaîne n'est pas affecté.
Stack technique
python
Domaine
backend
Type d'issue
Bug
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
Pythonpymc
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
70