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Increase support for batched multivariate distributions

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#5 383 ouverte le 24 janv. 2022

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 (9 commentaires) (0 réactions) (0 assignés)Python (1 902 forks)batch import
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Description

The logp of several multivariate distributions does not work (or is not tested) for arbitrarily batched dimensions. Some cases I could confirm include:

  • MvNormal - #6897
  • MvStudentT #6897
  • KroneckerNormal
  • MatrixNormal
  • LKJCorr
  • LKJCholeskyCov
  • StickBreakingWeights (alpha) #6042
  • Wishart (may be fine to ignore) #8246
  • CARRV (maybe better to leave this one as is)

Reproducible code:

size = (4, 3)
pm.logp(pm.MvNormal.dist(mu=np.ones(2), cov=np.eye(2), size=size), np.ones((*size, 2)))
# ValueError: Invalid dimension for value: 3
pm.logp(pm.MvStudentT.dist(nu=3, mu=np.ones(2), cov=np.eye(2), size=size), np.ones((*size, 2)))
# ValueError: Invalid dimension for value: 3

Distributions that already support (and have tests for) arbitrary shapes

Guide contributeur

Direction de recherche
Inspectez l'implémentation de la méthode logp pour chaque distribution multivariée listée et suivez la gestion des formes pour identifier où les dimensions par lot échouent.
Stack technique
python
Domaine
datamachine learningaibackend
Type d'issue
Bug
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
3-5 jours
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
PythonPyMCProbability
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
55