pyg-team/pytorch_geometric

Graph Positional and Structural Encoder

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#8 310 ouverte le 1 nov. 2023

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Description

🚀 The feature, motivation and pitch

It would be great to add the "GPSE" (Graph Positional and Structural Encoder) module to PyG, which acts as a trained encoder for Graph Transformers. Most importantly, we should support loading pre-trained encoders and provide them to the user, e.g., via

encoder = GPSE.from_pretrained("molpcba")

Code: https://github.com/G-Taxonomy-Workgroup/GPSE Paper: https://arxiv.org/abs/2307.07107 Twitter: https://twitter.com/RemyLau3/status/1717194030986190899

Any help on this is highly appreciated :)

Alternatives

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Additional context

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Guide contributeur

Direction de recherche
Étudiez l'article GPSE et l'implémentation de référence, puis intégrez le mécanisme de chargement de l'encodeur pré entraîné dans le zoo de modèles PyG.
Stack technique
pythonpytorch
Domaine
machine learningapi
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
Une demi journée
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
PythonPyTorchGit
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
50