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List node features can not be sliced with subgraph

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#6 162 ouverte le 7 déc. 2022

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Description

How to pass subgraph Data as a node feature into main graph Data? test_data=Data(edge_index=edge_index,pos=torch.tensor(np.array(pos)), graph=subgraphList) subgraphList is as follows:

 Data(x=[1, 3], edge_index=[2, 0], pos=[1, 2]),
 ...
 Data(x=[10, 3], edge_index=[2, 18])]```
The issue is that when I tried to mask some nodes:
`mask_test_data=test_data.subgraph(mask)`
mask_test_data.graph is the same as test_data.graph, while the size of mask_test_data.pos is reduced from test_data.pos.

After testing, I found the issue is caused by the type of list. May I know whether there is another type of container in which I can store the subgraph Data, and it can auto-align with  `test_data.subgraph(mask)`?

[Slack Message](https://torchgeometricco.slack.com/archives/C01DN0B3B1N/p1670346485240969?thread_ts=1670346485.240969&cid=C01DN0B3B1N)

Guide contributeur

Direction de recherche
Inspectez la méthode subgraph() dans la classe Data de PyG pour comprendre comment elle copie les attributs. Le problème est que les attributs de liste ne sont pas découpés comme les attributs tenseurs. Examinez les méthodes cat dim et inc pour les types de données personnalisées. Envisagez d'utiliser un conteneur personnalisé ou de modifier la gestion des attributs pour prendre en charge le découpage.
Stack technique
pythonpytorch
Domaine
Aucun
Type d'issue
Bug
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Plutôt claire
Prérequis
PythonPyTorchPyG
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
60