nf-core/pathogensurveillance

Add alternative to `report_group_ids` column that takes column names to base groups on

Ouverte

#158 ouverte le 2 avr. 2025

Voir sur GitHubGuide contributeur
 (0 commentaire) (0 réaction) (1 personne assignée)Nextflow (9 forks)auto 404
good first issue

Métriques du dépôt

Stars
 (61 étoiles)
Métriques de merge PR
 (Métriques PR en attente)

Description

Similar to color_by, there could be a column called report_group_by that takes one or more column names and a report is made for each combination of values in those columns present in the input. This could work along side report_group_ids by converting the report_group_by into IDs and combining the IDs from the two columns.

Guide contributeur

Direction de recherche
Examinez comment la colonne `report group ids` est actuellement implémentée et traitée. Créez ensuite un mécanisme similaire pour `report group by` qui accepte des noms de colonnes et génère des identifiants de regroupement en conséquence.
Stack technique
groovy
Domaine
data
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-2 jours
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
GroovyNextflow
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
70