nf-core/genomeqc

GFFREAD fails

Fermée

#61 ouverte le 28 oct. 2024

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 (7 commentaires) (0 réaction) (1 personne assignée)Nextflow (24 forks)auto 404
buggood first issue

Métriques du dépôt

Stars
 (24 étoiles)
Métriques de merge PR
 (Merge moyen 1j 12h) (46 PRs mergées en 30 j)

Description

The pipeline didn't work downloading the arbidopsis thaliana reference genome from ncbi (GCF_000001735.4).

Guide contributeur

Direction de recherche
Vérifiez l'URL de téléchargement NCBI pour GCF 000001735.4, validez la configuration du pipeline pour le téléchargement du génome et inspectez les journaux d'erreurs.
Stack technique
Aucun
Domaine
backend
Type d'issue
Bug
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Plutôt claire
Prérequis
GitNextflow
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
60