nf-core/deepvariant

Deepvariant Version

Ouverte

#19 ouverte le 17 févr. 2019

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 (17 commentaires) (0 réaction) (0 personne assignée)Nextflow (26 forks)auto 404
feature-requestgood first issue

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Description

@ewels Hello,

  1. Could you update the pipeline to 0.72 version?

  2. If i run it locally on my pc, will it use my acceleration cores of my GPU?

Guide contributeur

Direction de recherche
Enquêtez sur l'endroit où la version de DeepVariant est définie dans le pipeline Nextflow et comment la mettre à jour. Considérez la question sur l'utilisation du GPU en vérifiant le conteneur DeepVariant et la configuration du pipeline pour le support GPU.
Stack technique
pythontensorflowdocker
Domaine
datamachine learning
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
2
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-3 heures
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Active
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Plutôt claire
Prérequis
GitNextflowDocker
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
75