microsoft/InnerEye-DeepLearning

Patch visualization: Highlight that areas that are never sampled

Open

#301 ouverte le 28 oct. 2020

Voir sur GitHub
 (0 commentaires) (0 réactions) (0 assignés)Python (519 stars) (138 forks)batch import
good first issuenot urgentreporting and diagnostics

Description

From the present thumbnails, it is not clear which pixels will never be included in training. Can we highlight those in a different color?

AB#3939

Guide contributeur

Stack technique
python
Domaine
machine learningdata
Type d'issue
feature
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
half day
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
fresh
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
mostly clear
Prérequis
Understanding of patch sampling in medical imagingFamiliarity with visualization code in the repository
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
60
Direction de recherche
Examine the existing thumbnail generation code in the repository (likely in the visualization module) to understand how patches are currently displayed. Identify the logic that determines which pixels are sampled for training. Modify the visualization to color unsampled pixels differently, e.g., by adding a semi transparent overlay. Review any related documentation or comments about sampling strategies to ensure accuracy.