biocore/empress

Show histograms of selected quantitative sample metadata fields as an alternative to the "sample presence information" table

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#443 ouverte le 8 nov. 2020

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Description

The current sample presence info tables are great for summarizing categorical metadata, but they don't scale well to quantitative fields (e.g. pH). It would be really cool if we could add an option to show a histogram for the selected tip / internal node that, for each sample containing the node or its descendants, shows the distribution of values for a selected sample metadata field.

I think getting an early version of this up using Vega-Lite wouldn't be too bad.

Guide contributeur

Direction de recherche
Explorez Vega Lite pour créer un histogramme interactif pour un champ de métadonnées quantitatives sélectionné, intégré dans le visualiseur d'arbres phylogénétiques existant.
Stack technique
javascript
Domaine
data visualizationbioinformatics
Type d'issue
Fonctionnalité
DifficultéDifficulté estimée pour un nouveau contributeur, de 1 pour un très petit changement à 5 pour un travail expert.
3
Temps estiméFourchette de temps approximative pour investiguer, implémenter, tester et préparer une pull request.
1-2 jours
Statut d'activitéDisponibilité apparente de l'issue : fraîche, active, ancienne, bloquée ou en attente d'un mainteneur.
Récente
ClartéClarté avec laquelle l'issue explique le changement attendu, les critères d'acceptation et la prochaine étape.
Claire
Prérequis
GitJavaScript
Accessibilité débutantScore de 1 à 100 estimant l'accessibilité de cette issue pour un premier contributeur.
60