wurmlab/sequenceserver

bed or gff alternate table format outputs

Offen

#501 geöffnet am 19.11.2020

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Beschreibung

We should enable a slightly-modified table output format that is gff or bed-like and can thus be more easily read into IGV

Contributor Guide

Research-Richtung
Untersuchen Sie die aktuelle Tabellenausgabe Generierung im Codebase, verstehen Sie die BLAST Ergebnisanalyse und implementieren Sie einen neuen Serialisierer für das BED oder GFF Format.
Tech Stack
javascript
Domain
backenddata visualization
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
2
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
1-3 Stunden
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
Git
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
70