r-bioinformatics/edgePy

Port limma and edgeR

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#1 geöffnet am 9. Mai 2018

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Beschreibung

From early commit of README.md:

limma and edgeR need to be ported. The dependency graphs for those libraries should be used as well.

Source: https://github.com/r-bioinformatics/edgePy/tree/72ca7f243fcff33f23118c30529de3bbded67c01

Contributor Guide

Research-Richtung
Überprüfen Sie die R Pakete limma und edgeR, um deren Funktionalität und Abhängigkeiten zu verstehen. Entwerfen Sie dann einen Python Implementierungsplan und beginnen Sie mit dem Portieren der Kernfunktionen.
Tech Stack
python
Domain
data
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
3-5 Tage
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Klar
Voraussetzungen
PythonGit
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
50