pymc-devs/pymc

Only sample using a single thread when sampling multiple chains in parallel

Geschlossen

#5.453 geöffnet am 09.02.2022

Auf GitHub ansehenContributor Guide
 (1 Kommentar) (0 Reaktionen) (0 zugewiesene Personen)Python (1.902 Forks)batch import
help wantedrequest discussionv4

Repository-Metriken

Stars
 (7.926 Sterne)
PR-Merge-Metriken
 (Durchschn. Merge 11T) (7 gemergte PRs in 30 T)

Beschreibung

My prior of what cores=4 does when calling pm.sample() is that pymc would use 4 of my cores. However, because of multi-threading this might not be the case. Furthermore, multi-threading is causing problems when running multiple chains in parallel: https://github.com/pymc-devs/pymc/issues/3140

I thus think we should set os.environ['OMP_NUM_THREADS'] = '1' if we're sampling on > 1 core.

Contributor Guide

Research-Richtung
Setze os.environ['OMP NUM THREADS'] = '1' in pm.sample(), wenn mehrere Ketten gesampelt werden, um Multithreading Konflikte zu vermeiden. Siehe Issue #3140 für Hintergrundinformationen. Stelle sicher, dass das Sampling einer einzelnen Kette nicht beeinträchtigt wird.
Tech Stack
python
Domain
backend
Issue Type
Fehler
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
2
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
1-3 Stunden
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Klar
Voraussetzungen
Pythonpymc
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
70