pyg-team/pytorch_geometric

Graph Positional and Structural Encoder

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#8.310 geöffnet am 1. Nov. 2023

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PR-Merge-Metriken
 (Durchschn. Merge 16T 3h) (13 gemergte PRs in 30 T)

Beschreibung

🚀 The feature, motivation and pitch

It would be great to add the "GPSE" (Graph Positional and Structural Encoder) module to PyG, which acts as a trained encoder for Graph Transformers. Most importantly, we should support loading pre-trained encoders and provide them to the user, e.g., via

encoder = GPSE.from_pretrained("molpcba")

Code: https://github.com/G-Taxonomy-Workgroup/GPSE Paper: https://arxiv.org/abs/2307.07107 Twitter: https://twitter.com/RemyLau3/status/1717194030986190899

Any help on this is highly appreciated :)

Alternatives

No response

Additional context

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Contributor Guide

Research-Richtung
Studieren Sie das GPSE Papier und die Referenzimplementierung und integrieren Sie dann den Lademechanismus für vortrainierte Encoder in den PyG Modellzoo.
Tech Stack
pythonpytorch
Domain
machine learningapi
Issue Type
Funktion
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
3
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
Halber Tag
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Klar
Voraussetzungen
PythonPyTorchGit
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
50