bigbio/proteomics-sample-metadata

Metabolomnics technology type

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#702 geöffnet am 22. Apr. 2024

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Beschreibung

We have two technology types for metabolomics:

  • LC-MS-based metabolomics: @mmattano used (https://github.com/bigbio/proteomics-sample-metadata/pull/680) in the PR the EDAM ontology NT=LC-MS-based metabolomics;AC=EDAM:3172 we should move this term to PSI-MS or PRIDE ontologies.
  • NMR metabolomics: Similar to the previous term, we should move it into PSI-MS or PRIDE ontologies. The main reason is because we use these two ontologies to handle data properties (comment).

To be discussed.

Contributor Guide

Research-Richtung
Identifizieren Sie die korrekten PSI MS oder PRIDE Ontologiebegriffe für LC MS basierte Metabolomik und NMR Metabolomik. Diskutieren und schlagen Sie Änderungen vor, um die Begriffe entsprechend zu verschieben.
Tech Stack
Keine
Domain
data
Issue Type
Refactoring
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
2
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
1-3 Stunden
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Aktiv
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Meist klar
Voraussetzungen
Keine
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
70